一次性碘伏棉簽的種類不同，使用方法有一定差異性，詳細的使用流程，需要參考其說明書。通常情況下，一次性碘伏棉簽棒需按照消毒前、消毒中、消毒后進行使用。
1、消毒前：打開碘伏棉簽的外包裝，將具有彩環標志的一側掰開后，待碘伏將棉簽浸濕，便可使用在傷口部位進行消毒。需注意，消毒時應注意無菌操作，避免手及其他污染物碰觸帶有碘伏的棉簽；
2、消毒中：若未出現感染或其它分泌物的傷口，即清潔傷口，如注射部位消毒，可從內向外消毒。當傷口出現感染，如痔瘡、肛瘺，或皮膚出現明顯膿腫或膿性分泌物時，也需從外向內消毒，以免感染擴散。但若膿腫未出現破潰，可從內向外消毒；
3、消毒后：待碘伏干燥后，可再次消毒，鞏固消毒效果。必要時，還可局部外用敷料，一次性碘伏棉簽使用后需分類處理，丟入醫療或感染垃圾袋內。
若傷口較大、較深，需及時前往醫院進行清創等處理。對于碘過敏的人群，需謹慎使用。若局部出現發紅、發炎、腫脹、持續疼痛，需停用且及時咨詢醫生，此外，也要避免接觸眼睛、插入鼻道或耳道部位，以免出現其他不良癥狀。
